中国启动“天梯计划” 将建万人规模“基因+免疫+临床”3D肿瘤数据库
3月1日,首届“肿瘤基因组与精准免疫治疗”高峰论坛在上海举行,国内首个专为肿瘤免疫治疗而发起的基因组合作计划“天梯计划”也在本次论坛上正式发布。
中国工程院院士詹启敏,上海市科委、北京大学肿瘤医院、河南省肿瘤医院、中国人民解放军总医院、上海市肺科医院等高校、科研机构、医疗机构和企业的200余位专家学者共同参与大会和见证了天梯计划的发布。共同探讨肿瘤治疗新范例;探索多方合作共同推动免疫治疗技术与基因组学技术结合的新方法;探究实现真正的肿瘤精准免疫治疗的新模式。
(北京大学吕有勇老师致辞)
免疫治疗迅猛发展,但“抗癌登月”仍需“天梯”
近年以来,以PD-1、CAR-T等为代表的免疫疗法在许多癌种上表现出了惊人的疗效。尽管免疫治疗的前景看好,但这一疗法目前仍存在诸多瓶颈。免疫治疗目前总体的反应率在不到30%,剩下70%多的患者不但要承受每年几十万的高昂治疗费用,还面临治疗产生的副作用问题和耐药性问题,同时更加缺乏免疫治疗的基因检测标准。目前普遍使用的PD-L1检测面临着预示效果不明显、缺乏有效的检测阈值标准等问题,如何根据基因组数据和机体免疫功能状态,为病人制定个性化的免疫疗法,实现精准诊断和精准治疗预测,成为肿瘤免疫治疗亟待解决的难题之一。
裕策生物高志博表示,将免疫治疗技术与基因组学技术结合,做到真正的肿瘤精准免疫治疗,成为当前国际上肿瘤免疫治疗研究的前沿。“天梯计划”由聚焦肿瘤基因组和免疫治疗的领先技术企业裕策生物发起,中国工程院院士詹启敏担任专家顾问委员会主任委员,目前已有近四十位是我国首个专为肿瘤免疫治疗而发起的基因组合作计划,旨在利用基因检测和大数据分析,调动免疫系统抗击癌症能力,加速癌症治疗研究,实现治愈癌症的登月壮举,建设合作、互利、共赢的抗癌“天梯”。
高志博同时透露,基因加免疫是“天梯计划”的核心,“天梯计划”将积极地与肿瘤研究机构和专家、医院机构和临床医生以及药企等展开合作。华大基因、香雪制药、聚道科技、桐树生物、艾吉泰康、源正细胞等在内的数十家机构都现场签约,为“天梯计划”的执行提供支持。
(天梯计划启动/签约现场)
基因+免疫, YuceOneTM助力实现肿瘤精准免疫治疗“天梯计划”
本次论坛上,裕策生物正式发布了国内首款指导肿瘤免疫治疗、靶向治疗、化疗的综合性基因检测产品 YuceOneTM Plus,以及国内首款基于多项指标评估免疫检查点抑制剂疗效的基因检测产品 YuceOneTM ICIs。
YuceOneTM Plus 是目前肿瘤精准治疗最全面的基因检测方案。基于最新的目标基因捕获技术、高通量测序技术、大数据分析技术,通过定制化的基因捕获芯片 YuceOneTM Plus-Kit 和专业高效的基因数据解读系统 YuceOneTM Reporter,只需一次检测,就能为患者同时提供 PD- 1 和 PD-L1 抑制剂疗效、预测肿瘤新抗原、靶向药的敏感性和耐药性、化疗药物的敏感性和毒副作用 4 大项治疗信息,并辅助性评估肿瘤患者家族的肿瘤易感性。
YuceOneTM ICIs 则是国内首个基于多项指标评估免疫检查点抑制剂疗效的基因检测产品。通过检测肿瘤突变负荷、肿瘤新抗原负荷、PD-L1 表达水平三项指标,对 PD- 1 或 PD-L1 抗体的疗效的进行更有效评估。
建立“两库一标”,中国天梯助免疫治疗跨越式突破
裕策生物创始人兼CEO高志博表示,预计到2020年,“天梯计划”将实现“两库一标”的战略目标,进而为临床肿瘤治疗的科学家和医生提供辅助治疗决策,为药企开发药物提供可信靶点选择,加速最新的癌症免疫疗法,实现肿瘤防治的跨越式突破。
所谓即“两库一标”,第一个库是指国内首个万人级别的3D肿瘤数据库。基于数据库的挖掘和分析,将能够为以PD-1药物为代表的免疫检验点抑制剂治疗建立疗效预测的方法和标准,为细胞免疫治疗建立肿瘤特异性抗原(neoantigen)的检测方法和标准,为免疫治疗技术的研发和发展奠定基础。进而指导部分患者进行精准、个性化的免疫治疗,提升临床治疗效果,为精准免疫治疗积累经验。
第二个库是指国内首个专业全面、更新及时的肿瘤免疫知识库。包括与肿瘤免疫治疗相关的最新技术进展、临床试验、临床案例、行业动态等信息,能够为行业提供最新的技术进展和行业动态,以促进行业技术进步和共同发展,非专业人士则能够从中获取最新的临床和技术动态,促进免疫治疗、基因检测技术的科普教育。
“一标”是指建立国内首个开源、开放的肿瘤免疫治疗基因检测评测体系和标准。集中行业力量,共同解决相关技术难点和痛点,从而指导行业内各机构有效地开展标准检测流程。(生物谷Bioon.com)
JCI:研究揭示代谢性疾病中基因与环境的影响
Nature:吊炸天!在体筛选800多个基因发现阻止癌症转移的新靶点
2017年1月13日讯 /生物谷BIOON/ –来自英国桑格研究院的一项新研究为遏制肿瘤转移找到了新的药物靶点。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature上。这项研究共发现23个参与癌细胞转移调控的基因,研究人员证明靶向其中一个基因——Spns2能够显著抑制肿瘤扩散。
肿瘤转移是导致癌症病人死亡的首要原因。高达90%的癌症死亡都因癌症转移而发生,但是目前对癌症转移的调控机制仍了解不足。
为了找出影响癌细胞转移的基因,研究人员借助敲除了单个基因的多种基因工程小鼠对肿瘤转移过程进行了研究。他们筛选了810个基因在其中发现了23个促进或抑制皮肤肿瘤细胞向肺部扩散的基因。其中的许多基因还会引起免疫系统的变化。
移除Spns2基因会引起最显著的变化,可以大大抑制肿瘤向肺部的扩散。随后研究人员又检测了该基因对其他癌症扩散的作用,包括结肠癌,肺癌和乳腺癌,并发现敲除Spns2也会抑制这几种癌症的转移。
来自桑格研究院的Dr. David Adams这样说道:“Spns2基因的缺失会导致肿瘤转移灶的形成受到显著抑制,因此该基因代表了一个新的药物靶点。我们发现缺失Spns2基因的小鼠其免疫细胞的比例也不同于正常小鼠,似乎该基因的缺失会促进免疫系统清除癌细胞。靶向该基因的药物或许可以帮助抑制或阻止癌细胞向身体其他部位的扩散。”
在该研究之前,有研究发现Spns2基因能够影响免疫系统,但是并未将其与肿瘤扩散联系在一起。该基因编码的蛋白能够对S1P这种脂质进行转运,S1P可以向免疫系统传递信号,在缺少转运蛋白后该信号不能正常运作从而导致机体内不同免疫细胞的比例发生变化。
该研究为抑制甚至阻止癌细胞转移提供了一个新的药物靶点,未来有望借助该方法达到治疗癌症的目的。(基因宝jiyinbao.com)
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Genome-wide in vivo screen identifies novel host regulators of metastatic colonization
Louise van der Weyden, Mark J. Arends, Andrew D. Campbell, Tobias Bald, Hannah Wardle-Jones, Nicola Griggs, Martin Del Castillo Velasco-Herrera, Thomas Tüting, Owen J. Sansom, Natasha A. Karp, Simon Clare, Diane Gleeson, Edward Ryder, Antonella Galli, Elizabeth Tuck, Emma L. Cambridge, Thierry Voet, Iain C. Macaulay, Kim Wong, Sanger Mouse Genetics Project, Sarah Spiegel, Anneliese O. Speak & David J. Adams
Nature 子刊:史上规模最大全基因组测序发现了啥?
香港中大破解鼻咽癌全基因组图谱
世界最大的自闭症基因组数据库公布
EMBO Rep:特殊基因缺陷或帮助开发前列腺癌潜在靶向疗法
图片摘自:www.huffingtonpost.co.uk
2016年9月7日 讯 /生物谷BIOON/ –近日,刊登在国际杂志EMBO Reports上的一项研究报告中,来自哥廷根大学医学中心的科学家通过研究发现,前列腺肿瘤中频繁突变的基因CHD1的缺失或许可以使得前列腺癌细胞对多种药物变得敏感,其中包括PARP药物在内,这就表明,CHD1或许就是靶向前列腺癌疗法的潜在生物标志物。
文章中,研究人员利用人类前列腺癌细胞系进行研究并且降低CHD1的DNA结合蛋白的水平,CHD1基因在大约15%-27%的前列腺肿瘤中都处于突变状态,而且诸如这样的突变同前列腺癌患者的染色体不稳定性及较差的预后直接相关;研究者Steven Johnsen指出,剔除CHD1的细胞往往会出现同源性重组(HR)过程的缺失,而同源性重组是修复DNA破碎断裂的关键分子机制,相关研究数据表明,CHD1的正常功能就是使得破碎位点周围的DNA松弛,目的是为了促进同源性重组修复蛋白的进入,更重要的是,像癌细胞及同源性重组过程出现的其它突变一样,剔除CHD1的前列腺癌细胞被证明对于引发DNA断裂的化疗药物超级敏感,比如丝裂霉素C、伊立替康和PARP抑制剂等。
Johnsen说道,我们非常高兴该研究具有一定的转化潜能,目前我们正在同制药公司进行接触来尝试将我们的实验室研究结果转化到临床研究中去;尤其我们发现了携带其它同源性重组通路缺失的细胞,比如在乳腺癌和卵巢癌细胞中频繁出现的BRCA突变,这些细胞对于酶类PARP的抑制作用非常敏感,而且PARP抑制剂奥拉帕尼(Olaparib)也被批准用于治疗BRCA突变的卵巢癌。
目前,PARP抑制剂正在前列腺癌的疗法中进行检测,药物奥拉帕尼的II期临床试验结果表明,增加转移性前列腺癌患者的放射性无进展生存期或许能够指示患者机体同源性重组修复缺失的基因组异常表现。研究者认为,对样本中CHD11基因的回顾性分析或许能够揭示利用CHD1作为一种生物标志物来改善对前列腺癌患者的分层以及利用PARP抑制剂开发靶向疗法的进展。(基因宝jiyinbao.com)
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Loss of CHD1 causes DNA repair defects and enhances prostate cancer therapeutic responsiveness
Vijayalakshmi Kari, Wael Yassin Mansour, Sanjay Kumar Raul, Simon J Baumgart, Andreas Mund, Marian Grade, Hüseyin Sirma, Ronald Simon, Hans Will, Matthias Dobbelstein, Ekkehard Dikomey, View ORCID ProfileSteven A Johnsen
The CHD1 gene, encoding the chromo‐domain helicase DNA‐binding protein‐1, is one of the most frequently deleted genes in prostate cancer. Here, we examined the role of CHD1 in DNA double‐strand break (DSB) repair in prostate cancer cells. We show that CHD1 is required for the recruitment of CtIP to chromatin and subsequent end resection during DNA DSB repair. Our data support a role for CHD1 in opening the chromatin around the DSB to facilitate the recruitment of homologous recombination (HR) proteins. Consequently, depletion of CHD1 specifically affects HR‐mediated DNA repair but not non‐homologous end joining. Together, we provide evidence for a previously unknown role of CHD1 in DNA DSB repair via HR and show that CHD1 depletion sensitizes cells to PARP inhibitors, which has potential therapeutic relevance. Our findings suggest that CHD1 deletion, like BRCA1/2 mutation in ovarian cancer, may serve as a marker for prostate cancer patient stratification and the utilization of targeted therapies such as PARP inhibitors, which specifically target tumors with HR defects.
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