基因时代
就找基因君

研究证明:熬夜会丢失你的抑癌基因,促癌蛋白c-myc产生

基因君

研究证明:熬夜会丢失你的抑癌基因,促癌蛋白c-myc产生

很多关于癌症危险因素的研究有发现,熬夜,正如近15%的美国人所做的那样,会增加患癌风险。麻省理工学院的生物学家目前发现了或许可以解释此风险增加的关联。

在人类和大多数其他生物体中,由光支配的生物钟,通过控制细胞活动来调节人体生理的关键方面,这些细胞活动包括新陈代谢和细胞分裂。在小鼠研究中,MIT的研究小组发现在控制细胞生物戒律的基因中,有两个基因也具有作为肿瘤抑制子的作用。

这些肿瘤抑制基因的丢失,无论是通过基因敲除还是正常的光/暗循环导致的破坏,都将使肿瘤的侵袭性变强。

“如何扰乱生物戒律无关紧要,重要的是,扰乱之后似乎会推动肿瘤发生,”麻省理工学院科赫研究所综合癌症研究前博士后和研究的主要作者Thales Papagiannakopoulos说。该研究于7月28日发表在《细胞新陈代谢》上。

Tyler Jacks是科赫研究所和生物学的戴维H科赫生物学教授的主任,也是论文的资深作者。

打破生物钟

在人类中,中央生物钟位于大脑的视交叉上核(SCN),它接收来自视网膜的光信息。SCN通过激素和其他信号分子将其信息交流给细胞。

在细胞内,一个被称为BMAL1的基因负责激活控制昼夜活动的其他基因,包括一个叫Per2的基因。由这些基因编码的蛋白质水平,正常情况下在一天之中会波动,但是当正常光/暗周期被破坏时,这些波动就会消失。

“细胞需要光的提示,这就好像时钟需要复位按钮。当失去了指示的东西,你身体的每一个细胞都会失去正常的节奏。”纽约大学医学院病理助理教授Papagiannakopoulos说。

他和他的同事们着手调查小鼠癌症与这些基因之间可能存在的联系,这些小鼠进过基因改造而患上了一种被称为非小细胞肺癌肺癌的癌症。

开始时,他们将小鼠暴露于两种不同的亮/暗时间表。一组小鼠住在一起,昼夜时间与正常相同,即12小时的光照接着12小时的黑暗,而另一组小鼠接受一张 “时差”时间表:每两至三天,将它们多在光下暴露八个小时。这是在模仿人类上夜班或通过多个时区旅行时发生的生物钟混乱现象。

结果,第二组小鼠的肿瘤比第一组的长得更快。

在他们的下一组实验中,研究人员将继续让小鼠接受正常的光/暗时间表,但会敲出BMAL1和Per2基因。在那些老鼠中,肿瘤生长速度较快,就像它们在“时差”时间表中的表现一样。

“如果破坏了你身体每一个细胞的这些基因,你通常无法利用接收到的光,”Papagiannakopoulos说:“这就像用一个分子锤子打破了生物钟。”

失控的生长

BMAL1与Per2基因控制着一个被称为c-myc的促癌蛋白的制造时机,所以,当这些基因被破坏时,c-myc开始积累,刺激细胞代谢、加快增殖。

“C-myc基因打开这个使细胞产生更多代谢物、更多营养物质和新细胞产生所需的更多原料的程序。它对细胞增殖的能力很重要。”Papagiannakopoulos说。

Joseph Takahashi是得克萨斯大学西南医学中心神经科学部的系主任。他没有亲自参与实验,但是他说:“这项研究为我们展现了癌症和生物钟功能障碍之间的重要纽带。这项工作是非常清晰和明确的,它可能正是我们阐明生物钟可能对良恶性肿瘤存在抑制作用所需要的。”

麻省理工学院的研究人员还分析了人肺肿瘤样品,他们发现,肺部肿瘤组织中BMAL1与Per2基因以及其他关键的生物钟基因的表达水平比健康组织中更低。最具侵略性的肿瘤中,这些基因的表达水平甚至更低。

Papagiannakopoulos目前正在研究的是,通过BMAL1和Per2基因丢失的等方式破坏细胞的生物钟之后,例如癌细胞,是否会出现弱点?而这些弱点是否有可能被加以利用,作为潜在的药物靶点。他还计划研究破坏昼夜节律如何影响其他类型的癌症,包括胰腺癌。(基因宝jiyinbao.com)

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2016癌症、炎症与免疫–微环境下的对话

会议时间:2016.09.02-2016.09.03     会议地点:上海

会议详情: http://www.bioon.com/z/2016Inflammation/Index.shtml

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在人类和大多数其他生物体中,由光支配的生物钟,通过控制细胞活动来调节人体生理的关键方面,这些细胞活动包括新陈代谢和细胞分裂。在小鼠研究中,MIT的研究小组发现在控制细胞生物戒律的基因中,有两个基因也具有作为肿瘤抑制子的作用。

这些肿瘤抑制基因的丢失,无论是通过基因敲除还是正常的光/暗循环导致的破坏,都将使肿瘤的侵袭性变强。

“如何扰乱生物戒律无关紧要,重要的是,扰乱之后似乎会推动肿瘤发生,”麻省理工学院科赫研究所综合癌症研究前博士后和研究的主要作者Thales Papagiannakopoulos说。该研究于7月28日发表在《细胞新陈代谢》上。

Tyler Jacks是科赫研究所和生物学的戴维H科赫生物学教授的主任,也是论文的资深作者。

打破生物钟

在人类中,中央生物钟位于大脑的视交叉上核(SCN),它接收来自视网膜的光信息。SCN通过激素和其他信号分子将其信息交流给细胞。

在细胞内,一个被称为BMAL1的基因负责激活控制昼夜活动的其他基因,包括一个叫Per2的基因。由这些基因编码的蛋白质水平,正常情况下在一天之中会波动,但是当正常光/暗周期被破坏时,这些波动就会消失。

“细胞需要光的提示,这就好像时钟需要复位按钮。当失去了指示的东西,你身体的每一个细胞都会失去正常的节奏。”纽约大学医学院病理助理教授Papagiannakopoulos说。

他和他的同事们着手调查小鼠癌症与这些基因之间可能存在的联系,这些小鼠进过基因改造而患上了一种被称为非小细胞肺癌肺癌的癌症。

开始时,他们将小鼠暴露于两种不同的亮/暗时间表。一组小鼠住在一起,昼夜时间与正常相同,即12小时的光照接着12小时的黑暗,而另一组小鼠接受一张 “时差”时间表:每两至三天,将它们多在光下暴露八个小时。这是在模仿人类上夜班或通过多个时区旅行时发生的生物钟混乱现象。

结果,第二组小鼠的肿瘤比第一组的长得更快。

在他们的下一组实验中,研究人员将继续让小鼠接受正常的光/暗时间表,但会敲出BMAL1和Per2基因。在那些老鼠中,肿瘤生长速度较快,就像它们在“时差”时间表中的表现一样。

“如果破坏了你身体每一个细胞的这些基因,你通常无法利用接收到的光,”Papagiannakopoulos说:“这就像用一个分子锤子打破了生物钟。”

失控的生长

BMAL1与Per2基因控制着一个被称为c-myc的促癌蛋白的制造时机,所以,当这些基因被破坏时,c-myc开始积累,刺激细胞代谢、加快增殖。

“C-myc基因打开这个使细胞产生更多代谢物、更多营养物质和新细胞产生所需的更多原料的程序。它对细胞增殖的能力很重要。”Papagiannakopoulos说。

Joseph Takahashi是得克萨斯大学西南医学中心神经科学部的系主任。他没有亲自参与实验,但是他说:“这项研究为我们展现了癌症和生物钟功能障碍之间的重要纽带。这项工作是非常清晰和明确的,它可能正是我们阐明生物钟可能对良恶性肿瘤存在抑制作用所需要的。”

麻省理工学院的研究人员还分析了人肺肿瘤样品,他们发现,肺部肿瘤组织中BMAL1与Per2基因以及其他关键的生物钟基因的表达水平比健康组织中更低。最具侵略性的肿瘤中,这些基因的表达水平甚至更低。

Papagiannakopoulos目前正在研究的是,通过BMAL1和Per2基因丢失的等方式破坏细胞的生物钟之后,例如癌细胞,是否会出现弱点?而这些弱点是否有可能被加以利用,作为潜在的药物靶点。他还计划研究破坏昼夜节律如何影响其他类型的癌症,包括胰腺癌。(基因宝jiyinbao.com)

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Cell:将CRISPR和单细胞RNA测序结合在一起分析基因功能

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Cell:将CRISPR和单细胞RNA测序结合在一起分析基因功能

2016年12月17日/生物谷BIOON/—哪些突变组合有助癌细胞存活?大脑中哪些细胞参与阿尔茨海默病发生?免疫细胞如何执行它们的复杂决策过程?如今,在一项新的研究中,来自以色列魏兹曼科学研究所等机构的研究人员在一种方法中将两种强大的研究工具— CRISPR基因编辑和单细胞基因组分析—结合在一起,从而可能最终有助我们解答这些问题和更多的其他问题。相关研究结果发表在2016年12月15日那期Cell期刊上,论文标题为“Dissecting Immune Circuits by Linking CRISPR-Pooled Screens with Single-Cell RNA-Seq”。

这种新技术能够让研究人员在单细胞中操纵基因功能,和非常高分辨率地理解每种变化的结果。他们说,利用这种方法开展的单个实验可能相当于利用之前的方法开展的上千次实验,而且它可能加快基因工程领域的发展。

基因编辑技术CRISPR已正在改变着全世界生物学研究,而且它的临床使用马上就要来临了。CRISPR最初是在细胞中作为一种原始的获得性免疫系统而被发现的:它切割病毒DNA,并将它的部分片段粘贴到它们自己的基因组中来抵抗病毒。近年来,这种细菌系统已被科学家们用来快速地和高效地切割或插入几乎任何一种基因到任何一种有机体或细胞中。论文通信作者、魏兹曼科学研究所免疫学系Ido Amit教授说,“但是,就其本身而言,CRISPR是一种生硬的研究工具,这是因为我们经常很难观察到或理解这种基因组编辑的结果。迄今为止,大多数研究寻找非黑即白的效果,但是体内的绝大多数过程是复杂的,而且甚至是混乱的。”

Amit和他的实验室一直在开发这种新方法的第二部分:单细胞RNA测序。通过对每个细胞中的mRNA分子进行测序,他们能够揭示出每个细胞的分子组分,以及区分一种给定的细胞群体中细胞身份和功能的细微差别。Amit说,“它是一种新的分子显微镜。”来自体内特定组织中的上千个细胞能够在他的实验室中加以测序,从而可揭示出细胞身份和功能上的差异。这种方法已被用来理解从胎儿大脑发育的影响到常见的免疫细胞在我们体内的多种组织中如何发挥着不同的功能—包括它们参与癌症或神经退化—在内的任何事情。但是单细胞测序主要是一种观察工具,提供一种给定组织样品的快照图。

将CRISPR与高分辨率的单细胞RNA测序结合在一起能够让研究人员主动地调整细胞中的基因,然后理解它们在多种条件下在多种细胞中的功能。Amit和他的团队(包括论文第一作者Diego Adhemar Jaitin、Ido Yofe和Assaf Weiner,研究生David Lara-Astiaso)面临的挑战是改编CRISPR基因编辑技术以便它能够与单细胞测序结合在一起使用。Amit团队想象着一次靶向多种基因,包括靶向同一个细胞中的多个靶标,然后鉴定出给细胞带来的变化和这些基因的功能。一方面,这项任务需要开发新的分子技术以便同时鉴定出靶细胞和引入到它们当中的基因组编辑。另一方面,这项任务需要开发新的计算方法来分析具有不同基因型和表型的细胞群体。

研究人员随后遇到一种新的数据类型—伴随着一些遗失的数值。Weiner说,“通过将细胞与类似的行为关联在一起,Netflix算法等被用来将喜欢类似电影的人们进行归类,我们能够鉴定出很多基因之前未被分类的功能。” Weiner开发出这些算法来分析这些数据。

当特定的小鼠免疫细胞抵抗病原体时,这种组合方法能够让研究人员“探究和分析”它们。这种“原理验证”实验鉴定出在多种免疫系统功能中发挥重要作用的基因,并且高分辨率地解释它们如何指导一种复杂的集中反应来抵抗入侵的病原体。

Amit说,“CRISPR的降临代表着理解免疫回路和开始对它进行编辑的能力上取得真正的突破。我们正希望我们的方法将是下一个突破,以便能够对免疫细胞进行改造用于免疫疗法。”(生物谷 Bioon.com)

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Dissecting Immune Circuits by Linking CRISPR-Pooled Screens with Single-Cell RNA-Seq

Diego Adhemar Jaitin, Assaf Weiner5, Ido Yofe5, David Lara-Astiaso, Hadas Keren-Shaul, Eyal David, Tomer Meir Salame, Amos Tanay, Alexander van Oudenaarden, Ido Amit

doi:10.1016/j.cell.2016.11.039

BioMarin治疗A型血友病基因疗法临床数据抢眼

基因君

BioMarin治疗A型血友病基因疗法临床数据抢眼

2016年8月1日讯 /生物谷BIOON/ –基因疗法先驱BioMarin公司开发的用于治疗重度血友病A的基因疗法BMN270临床研究取得重大成功。公司预计,如果这一药物获得批准,公司预计每年将获得超过10亿美元的收入。BioMarin公司表示希望BMN270能够能为明年公司的四大支柱之一。

除了BMN270外,公司目前还对其余三种药物寄予厚望。其中一种是治疗软骨发育不全的vosoritide,该药物目前同样处于临床研究阶段;另外两种药物分别是pegvaliase和cerliponase alfa,均处于审批阶段。

下一步,公司计划开展BMN270的临床II期研究,公司希望获得更多实验数据,以获取FDA的加速审批待遇。BMN270是一种针对凝血因子VIII的基因疗法。凝血因子VIII是机体重要的凝血蛋白之一,编码该蛋白的F8基因异常可能导致白血病的发生。

在最近一次有9名患者参与的临床研究中,研究人员给其中7名患者以最高剂量的BMN270治疗剂量,经过治疗,其中6名患者的凝血因子VIII水平回声50%以上;其中四名患者的治疗效果在治疗后的20周内有明显提升,其凝血因子VIII达到了原来水平的146%左右。

另一方面,研究人员同时评价了该药物的安全性。在治疗中,高剂量BMN270疗法的患者在接受治疗后的两周内接受了类固醇疗法的治疗。但其ALT水平(代表药物的肝脏毒性标准)在治疗后12周接近正常上限的两倍,然后就缓慢回落。事实上,BioMarin公司此前就报道过两名未接受过类固醇疗法的BMN270患者肝脏酶水平异常升高,甚至公司因此曾一度暂定了该药物的研究。目前,公司正着手进行一项研究,以确定该药物的最适剂量和治疗周期。

不过,让BioMarin公司振奋的是,BMN270目前已经达到了公司的所有预期。而BMN270研究的顺利进行,无疑也为当前处于低迷状态的基因疗法打了一针强心剂。(基因宝jiyinbao.com)

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原始出处:BioMarin up on positive gene therapy data in hemophilia A

BioMarin治疗A型血友病基因疗法临床数据抢眼

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2016年8月1日讯 /生物谷BIOON/ –基因疗法先驱BioMarin公司开发的用于治疗重度血友病A的基因疗法BMN270临床研究取得重大成功。公司预计,如果这一药物获得批准,公司预计每年将获得超过10亿美元的收入。BioMarin公司表示希望BMN270能够能为明年公司的四大支柱之一。

除了BMN270外,公司目前还对其余三种药物寄予厚望。其中一种是治疗软骨发育不全的vosoritide,该药物目前同样处于临床研究阶段;另外两种药物分别是pegvaliase和cerliponase alfa,均处于审批阶段。

下一步,公司计划开展BMN270的临床II期研究,公司希望获得更多实验数据,以获取FDA的加速审批待遇。BMN270是一种针对凝血因子VIII的基因疗法。凝血因子VIII是机体重要的凝血蛋白之一,编码该蛋白的F8基因异常可能导致白血病的发生。

在最近一次有9名患者参与的临床研究中,研究人员给其中7名患者以最高剂量的BMN270治疗剂量,经过治疗,其中6名患者的凝血因子VIII水平回声50%以上;其中四名患者的治疗效果在治疗后的20周内有明显提升,其凝血因子VIII达到了原来水平的146%左右。

另一方面,研究人员同时评价了该药物的安全性。在治疗中,高剂量BMN270疗法的患者在接受治疗后的两周内接受了类固醇疗法的治疗。但其ALT水平(代表药物的肝脏毒性标准)在治疗后12周接近正常上限的两倍,然后就缓慢回落。事实上,BioMarin公司此前就报道过两名未接受过类固醇疗法的BMN270患者肝脏酶水平异常升高,甚至公司因此曾一度暂定了该药物的研究。目前,公司正着手进行一项研究,以确定该药物的最适剂量和治疗周期。

不过,让BioMarin公司振奋的是,BMN270目前已经达到了公司的所有预期。而BMN270研究的顺利进行,无疑也为当前处于低迷状态的基因疗法打了一针强心剂。(基因宝jiyinbao.com)

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原始出处:BioMarin up on positive gene therapy data in hemophilia A

Cell:震惊!单个GATA4基因突变导致两种心脏病类型

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Cell:震惊!单个GATA4基因突变导致两种心脏病类型

2016年12月17日/生物谷BIOON/—在一项新的研究中,来自美国格拉斯通研究所的研究人员发现单个基因突变与两种心脏病类型—一种心脏病会导致婴儿心脏有孔产生,另一种心脏病导致心力衰竭—存在关联。利用携带这种突变的家庭捐献的细胞,他们对先天性心脏病、人类心脏发育和健康的心脏功能产生新的认识。相关研究结果发表在2016年12月15日那期Cell期刊上,论文标题为“Disease Model of GATA4 Mutation Reveals Transcription Factor Cooperativity in Human Cardiogenesis”。论文通信作者为格拉斯通心血管疾病研究所主任Deepak Srivastava博士。

一个家庭故事:基因突变与先天性心脏病

先天性心脏病影响将近1%的新生婴儿。在一种特别常见的先天性心脏病类型中,在两个心室之间的隔膜中有孔形成。导致这些隔膜缺陷的一种原因是GATA4基因发生突变,其中GATA4是正常的心脏发育和健康的心脏功能所必需的。GATA4基因编码一种“主调节”蛋白,该蛋白激活或沉默参与心脏发育的其他基因。

这项新的研究涉及一个携带GATA4突变的先天性心脏病病人家庭。2003年,在这个家庭的一半婴儿出生时存在隔膜缺陷之后,该家庭就找到了Srivastava。利用基因测序,研究人员了解到这个先天性心脏病病人家庭的每个成员在GATA4基因上存在相同的突变—该基因中存在的单碱基变化。

7年后,这个家庭的几个成员(如今是青少年)患上一种独特的导致心肌异常泵血的心脏病。研究人员作出结论,相同的GATA4基因突变是这种心肌功能障碍的原因,但是他们不知道为何会这样。

GATA4的因果关系

为了解答这个问题,Srivastava团队获取来自这个家庭的皮肤细胞,利用干细胞技术将它们重编程为跳动的心脏细胞。这种技术允许该团队研究与这些病人具有相同遗传组成的心脏细胞以便确定这种GATA4基因突变如何导致这两种心脏病类型。

研究人员注意到利用病人的皮肤细胞经重编程构建出的心脏细胞存在几种异常:这些细胞比正常的心脏细胞跳动得较弱,而且这些细胞的多种基因被异常激活或沉默。比如,参与心脏形成的基因没有合适地开启,包括控制隔膜形成的基因。相比之下,参与其他器官发育的基因被激活,而它们原本应当被沉默。

Srivastava解释道,“通过研究盘碟中的这些病人的心脏细胞,我们能够找出他们的心脏为何不会正确地泵血。研究他们的基因突变揭示出一种完整的发生差错的基因网络,这种差错先会导致隔膜缺陷,随后会导致心肌功能异常。”

研究人员发现这种GATA4基因突变阻止另一种主调节蛋白TBX5被招募到心脏发育和心肌收缩所需的基因上。GATA4和TBX5一起激活负责心脏形成和功能的基因,和沉默参与其他器官的基因。然而,如果一种蛋白发生突变,那么另一种蛋白就不会很好地发挥作用。鉴于GATA4基因发生的单个突变,几乎GATA4和TBX5调节的整个基因网络会受到破坏,从而导致疾病产生。有意思的是,人TBX5发生突变也会导致心脏中有孔产生。

论文第一作者、格拉斯通研究所研究员Yen-Sin Ang博士说,“这种影响是如何广泛令人吃惊。我们改变一个基因中的单个碱基,而且整个心脏发育过程受到破坏。这项研究揭示出一个关键的心脏基因发生单个突变如何能够导致至少这两种疾病。”

深入研究为治疗方法打开大门

利用药物靶向GATA4等主调节蛋白是比较困难的,这是因为它们的影响是如此广泛。然而,研究人员的确发现一种位于GATA4下游的可能被用来治疗心脏病的潜在治疗靶标。

利用计算模拟来拓展针对这些心脏细胞的研究,研究人员鉴定出受到GATA4控制的在心脏功能中发挥重要作用的枢纽基因(gene hub)。他们认为这个枢纽基因可能通过药物靶向来校正由GATA4基因突变导致的一些损伤。显著的是,一种影响这个途径的药物已经存在,而且研究人员正在探究它是否作为一种潜在的心脏病治疗药物。(生物谷 Bioon.com)

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Disease Model of GATA4 Mutation Reveals Transcription Factor Cooperativity in Human Cardiogenesis

Yen-Sin Ang, Renee N. Rivas, Alexandre J.S. Ribeiro, Rohith Srivas, Janell Rivera, Nicole R. Stone, Karishma Pratt, Tamer M.A. Mohamed, Ji-Dong Fu, C. Ian Spencer, Nathaniel D. Tippens, Molong Li, Anil Narasimha, Ethan Radzinsky, Anita J. Moon-Grady, Haiyuan Yu, Beth L. Pruitt, Michael P. Snyder, Deepak Srivastava

doi:10.1016/j.cell.2016.11.033

Leukemia:新研究绘制白血病基因突变图谱

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Leukemia:新研究绘制白血病基因突变图谱
2016年7月31日讯 /生物谷BIOON/ –来自新加坡癌症科学研究所的研究人员发现了促进急性早幼粒白血病(APL)发生的新基因变异。APL是急性髓系白血病的一个亚型,在该病的发病过程中会出现早幼粒细胞的异常积累。这项研究共包含了大约220个病人样本,其中既包括新诊断病例又包括复发病例。这些样本来自新加坡,德国,印度,美国和台湾等国家和地区。相关研究结果发表在国际学术期刊Leukemia上,该研究将为进一步提高APL的诊断和治疗效果铺平道路。
 
新发病例和复发病例中的突变
 
文章作者表示:"病人通常对全反式维甲酸(ATRA)和三氧化二砷(ATO)这两种治疗方法应答较好,这两种方法也是治疗APL的优选模式。但是仍然存在一些病人不能对标准疗法产生应答,或者会在治疗后出现复发。众所周知在APL疾病中染色体变异会导致PML与RARA基因发生融合,这是该病的一个重要基因事件,但许多研究也证明其他基因异常与PML-RARA癌基因一起共同促进了APL的发展。因此揭示该疾病全部的分子图谱是一项非常有价值的工作。"
 
研究人员首先在新发APL病例中发现了一些居于次要地位的基因变异,其中包括许多在APL中新发现的突变。其中在ARID1A和ARID1B这两个同家族基因上发现的致病突变尚属首次,有研究表明这两个基因的产物参与形成染色质重塑复合体。这些突变的发生表明在APL中存在表观遗传机制的失调,同时还帮助研究人员找到了一些之前从未发现参与白血病发生的基因。
 
而在复发病例中,研究人员发现了一些在新诊断病例中没有观察到的基因改变,大多数发生在RARA和PML基因上的重要突变只存在于复发病例。该研究还表明这些突变主要存在于诊断后分别接受ATRA治疗和ATO治疗的两个不同病人群体。
 
研究人员表示:"我们对新发病例和复发病例的突变图谱研究帮助我们建立了APL的分子地图,这与其他AML亚型是不同的。我们将会进行进一步研究揭示这些新突变的作用,从而不断加深对该疾病的了解,最终开发出更好地诊断和靶向治疗方法。"(基因宝jiyinbao.com)
 
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Comprehensive mutational analysis of primary and relapse acute promyelocytic leukemia
 
V Madan1, P Shyamsunder1,23, L Han1,2,23, A Mayakonda1,23, Y Nagata3, J Sundaresan1, D Kanojia1, K Yoshida3, S Ganesan4, N Hattori1, N Fulton5, K-T Tan1, T Alpermann6, M-C Kuo7, S Rostami8, J Matthews9, M Sanada3, L-Z Liu1, Y Shiraishi10, S Miyano10, E Chendamarai4, H-A Hou11, G Malnassy5, T Ma12, M Garg1, L-W Ding1, Q-Y Sun1, W Chien1, T Ikezoe13, M Lill14, A Biondi15, R A Larson16, B L Powell17, M Lübbert12, W J Chng1,2,18, H-F Tien11, M Heuser19, A Ganser19, M Koren-Michowitz20,21, S M Kornblau9, H M Kantarjian9, D Nowak22, W-K Hofmann22, H Yang1, W Stock5, A Ghavamzadeh8, K Alimoghaddam8, T Haferlach6, S Ogawa3, L-Y Shih7, V Mathews4,24 and H P Koeffler
 
Acute promyelocytic leukemia (APL) is a subtype of myeloid leukemia characterized by differentiation block at the promyelocyte stage. Besides the presence of chromosomal rearrangement t(15;17), leading to the formation of PML-RARA (promyelocytic leukemia-retinoic acid receptor alpha) fusion, other genetic alterations have also been implicated in APL. Here, we performed comprehensive mutational analysis of primary and relapse APL to identify somatic alterations, which cooperate with PML-RARA in the pathogenesis of APL. We explored the mutational landscape using whole-exome (n=12) and subsequent targeted sequencing of 398 genes in 153 primary and 69 relapse APL. Both primary and relapse APL harbored an average of eight non-silent somatic mutations per exome. We observed recurrent alterations of FLT3, WT1, NRAS and KRAS in the newly diagnosed APL, whereas mutations in other genes commonly mutated in myeloid leukemia were rarely detected. The molecular signature of APL relapse was characterized by emergence of frequent mutations in PML and RARA genes. Our sequencing data also demonstrates incidence of loss-of-function mutations in previously unidentified genes, ARID1B and ARID1A, both of which encode for key components of the SWI/SNF complex. We show that knockdown of ARID1B in APL cell line, NB4, results in large-scale activation of gene expression and reduced in vitro differentiation potential.

西雅图基因三阴性乳腺癌药物数据惊人,将进军实体瘤!

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西雅图基因三阴性乳腺癌药物数据惊人,将进军实体瘤!

2016年12月16日讯 /生物谷BIOON/ —如果进一步临床试验支持早期临床试验获得的阳性结果,西雅图基因技术公司将会把它的重心由血癌转移至实体瘤。

在圣安东尼奥乳腺癌研讨会上,该公司展示了他们使用抗体-药物偶联物治疗三阴性转移性乳腺癌尤其难治疗人群的1期临床试验结果,表明该药物疗效显著,前景大好。

这个药物由一个LIV-1靶向单克隆抗体键合细胞杀伤药物monomethyl auristatin E(MMAE)组成,是西雅图基因四个实体瘤临床药物的候选药物之一。

Leerink的分析师说,考虑到实体瘤是一个持续火热的领域,这个药物居然可以在对任何临床药物都不反应的病人身上产生37%的反应率,对于一种单一药物而言,这个结果十分令人震惊。

每年的167万乳腺癌新发病例中,有15%-20%的病人是三阴性乳腺癌,意味着她们缺乏三个生物标记物的表达(雌激素受体、孕酮受体及HER2),因此靶向药物对她们无效,同时她们的病情更容易恶化,病人预后较差。

西雅图基因的药物Adcetris作为经典霍奇金淋巴瘤(HL)二线治疗药物已经上市5年了,迄今为止超过30000例病人使用过这个药物。

近期投资者的关注将可能是该公司继续扩张Adcetris销售的机会,他们预测北美的销售额将达到每年2.6-2.7亿美元。

西雅图基因最近还报道了治疗皮肤T细胞淋巴瘤试验的阳性结果,将支持进一步的试验。另一项支持HL一线治疗的临床试验明年将有结果。同时该公司的急性髓性白血病(AML)候选药物vadastuximab talirine(SGN-CD33A)已经在5月开始临床试验注册,将在2019年得到临床试验数据。

Leerink分析师认为:“尽管大多数投资者都聚焦于治疗HL的Adcetris和AML候选药物SGN-CD33A,我们认为实体瘤领域将是一个重要的增值领域。”

他们认为相比于其他正在开发的三阴性乳腺癌候选药物,SGN-LIV1A的数据看起来更令人振奋。(基因宝jiyinbao.com)

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参考原文:Seattle Genetics chalks up further clinical trial success in solid tumors

Science子刊:新型基因疗法或可有效治疗肌肉萎缩

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Science子刊:新型基因疗法或可有效治疗肌肉萎缩

图片摘自:www.schlespain.com

2016年7月31日 讯 /生物谷BIOON/ –一项发表在国际杂志Science Translational Medicine上的研究报告中,来自华盛顿州立大学的研究人员通过研究开发了一种用于治疗肌肉萎缩的新型基因疗法,该研究或可拯救数百万遭受肌肉萎缩疾病患者的生命。

研究者Rodgers教授说道,慢性疾病影响着世界超过一半人口的健康,而其中大多数慢性疾病都伴随着患者机体的肌肉萎缩;慢性疾病的发生通常都以慢性感染、肌营养不良症、营养不良或年龄增长开始,大约一半死于癌症的人群实际上都会因肌肉萎缩而死亡,而且目前并没有特殊的疗法来治疗肌肉萎缩。

在这项研究中,研究者详细描述了他们如何在健康小鼠机体中构建肌肉组织,并且如何抑制携带肿瘤的小鼠机体中骨骼肌和心脏肌肉的缺失。在恶病质疾病中,肿瘤会分泌出特殊激素来促进肌肉退化,然而实际上机体会“吃掉”自己的肌肉,从而引发虚弱、疲惫等特点。研究者认为,引发很多人死亡的并不是骨骼肌的缺失,而是心肌的缺失,从而导致心脏萎缩进而引发心力衰竭。长期以来研究者一直想寻找特殊方法阻断该过程,但却并未成功过,因为引发肌肉萎缩的激素,尤其是一种名为肌肉生长抑制素(Myostatin)的天然激素在机体任何地方都扮演着重要的角色。

如今研究者就需要开发一种仅在肌肉中阻断肌肉生长抑制素的方法,即利用一种腺病毒伴随病毒来特异性地靶向作用心肌和骨骼肌;这种病毒可以将名为Smad7的信号蛋白运输到肌肉细胞中,Smad7蛋白随后就会阻断另外两种名为Smad2和Smad3的信号蛋白,这两种蛋白可以被肌肉生长抑制素和其它肌肉萎缩激素所激活,通过阻断这些信号,Smad7就可以阻断肌肉的萎缩。

研究者Rodgers说道,Smad7是机体的天然防火线,通过抑制抑制子我们就可以重新构建肌肉组织,对于恶病质患者而言,诸如这样的疗法或许就可以大大增加患者的生存率。早在2015年,研究者Rodgers就创建了AAVogen公司,该公司将会开发名为AVGN7的商业化药物,他表示,之所以创建这家公司,目的就在于我们想将科学成果推向社会,并且使其得到实际的应用,如今我们实现了这个目的,并且挽救了很多患者的生命。(基因宝jiyinbao.com)

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Smad7 gene delivery prevents muscle wasting associated with cancer cachexia in mice

Catherine E. Winbanks1, Kate T. Murphy2, Bianca C. Bernardo1, Hongwei Qian1, Yingying Liu1, Patricio V. Sepulveda1, Claudia Beyer1, Adam Hagg1, Rachel E. Thomson1, Justin L. Chen1,3, Kelly L. Walton3, Kate L. Loveland4, Julie R. McMullen1,5,6, Buel D. Rodgers7, Craig A. Harrison3,4,6, Gordon S. Lynch2 and Paul Gregorevic1,2,4,8,*

An unfortunate morbidity associated with cancer is muscle wasting, known as cachexia, where healthy cells erode in the face of malignancy. Cachexia has been difficult to treat, and the most promising new therapies inhibiting ActRIIB ligands, such as myostatin, a protein that promotes muscle breakdown, have been pulled after clinical trials indicated safety issues. Targeting ActRIIB ligands may still be possible—just in a different way, to avoid toxicity. Winbanks et al. demonstrated that gene therapy could be used to block ActRIIB ligands’ catabolic signaling. Delivering the gene Smad7 to mice with tumors prevented muscle atrophy and preserved muscle mass and force production by inhibiting ActRIIB signaling. The Smad7 gene therapy did not affect other organs, suggesting that safely targeting ActRIIB signaling is possible.

仰卧起坐引发的背痛或与基因相关

基因君

原标题:做仰卧起坐或有风险

仰卧起坐引发的背痛或与基因相关

一直以来很多人都认为,仰卧起坐是有效的腹肌锻炼方法。在中小学体质测定时,仰卧起坐也是测定内容之一。

最新研究表明,仰卧起坐可能会引起下腰痛、颈部拉伤、下腹部器官损伤,甚至腰椎损伤。我国台湾还出现了因做仰卧起坐造成瘫痪的报道。

存在一定危害

对仰卧起坐的危害的研究,不得不提加拿大滑铁卢大学脊柱生物力学教授Stuart McGill。McGill在实验室里重复性地屈伸取自猪的脊柱,来模拟人连续几个小时做仰卧起坐的情况。他发现,当脊柱前伸时,椎间盘几乎被挤压膨出。人若发生这种情况,必然会引起神经受压、后背疼痛,甚至出现椎间盘突出。对多种锻炼腹肌方法时,腰椎压力的研究表明,无论直腿或屈膝仰卧起坐,推算出的腰椎受压载荷都超过3000牛顿。

为此,美国国家职业安全卫生研究所还特意将职业活动中。下腰部压力极限设定为3300牛顿;超过此限的重复性动作常与工人的高受伤几率有关。2005年,美军的报道称56%的损伤与体能测试中的仰卧起坐有关。由于这一动作对脊柱的压力大,容易导致下腰痛,美国体能训练师和军队训练认为仰卧起坐是危险的;美国陆军已经开始对部分士兵停止仰卧起坐测试,此外,美国海军和海军陆战队也在考虑新的测试方法。

无独有偶,加拿大军队已用举起40磅沙包来代替仰卧起坐测试。很多体能教练和研究者都建议,采用平板支撑来代替仰卧起坐来锻炼腹肌。

或与基因相关

McGill的研究是取自猪的脊柱,有研究者认为这显然跟人的情况并不一样。

实验中,McGill上千次重复不停地屈伸脊柱。而实际上,他的实验模拟的是一种极端情况,也就是说几小时不停地做仰卧起坐才可能会导致如此的后果。实际上,椎间盘受损多是发生在做15次/组仰卧起坐时。

研究也证实,75%的出现背部问题可能更多归因于基因。另一项开始于1991年,由芬兰、加拿大和美国学者对单卵双生人群的研究,发现在腰椎退化的过程中,基因扮演着重要角色。比如,双胞胎中一人长期从事高负荷体力劳动,而另一人缺乏运动,两者出现后背问题的概率几乎一样。就是说,仰卧起坐会不会对背部造成损害因人而异。

须因人而异

任何体育活动都存在风险。人们在选择运动项目时要结合自身情况,同时不合理、不规范的动作也可能产生损伤。正如McGill所言,在做仰卧起坐时,姿态的改变可降低损伤风险。比如将双手手掌向下平放至背后防止后背在下落过程中与地板直接接触,从而降低后背压力,同时一腿伸直另一腿屈膝,这一姿势,腹肌用力将头部和肩膀略微拉离地面,好比将头放在磅秤上,然后用力将头拉起,让磅秤数字显示为零一样。

仰卧起坐动作不正确或幅度太大,肌肉更容易出现劳损,骨骼发育也会受影响,有诱发腰椎间盘突出的潜在风险。正确动作是:双手自然伸直平放体侧或双手交叉置于胸前;双手置于颈后、耳侧或头后时,不要用双手抱头;在“起坐”阶段,颈部、肩部和腹部不要过分屈,用肌肉的力量将上身拉起而不是卷起。如不清楚最好找专业指导,或看正确动作视频

另外,脊柱的屈伸动作一般每次练习不要超过60次,可以从15次开始,然后随着身体逐渐适应,循序渐进增加动作次数。

最后,在早上刚起床或静坐很久,就做仰卧起坐的话,受伤风险明显增加。如果在早上起床就屈伸动作,脊椎的压力大约是2~3小时后再做的3倍左右。看来,在办公室坐很久或者早上一起床就做仰卧起坐是不可取的。人们可以适当先走动或在其他运动之后再做。

对于那些久坐不运动、腰部力量弱的人群、脊椎本身就有损伤或有疾病以及腰椎不稳的人,应咨询专业人员,根据个体情况决定是否可以练习仰卧起坐,或用其他动作替代。(生物谷Bioon.com)

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