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2015年12月7日 讯 /生物谷BIOON/ –近日，来自曼彻斯特大学等处的科学家通过研究揭示了基因间的空白区域如何相互作用来影响个体患获得性疾病的风险，比如关节炎和I型糖尿病等，相关研究发表于国际杂志Nature Communications上；文章中研究者表示，DNA折叠时内部的空白区域对于基因的开启及表达非常重要，实际上此前认为这些空白区域同基因相互作用并不会引发疾病，而如今很多基因都被认为可以增加人们患多种疾病的风险。
研究者Stephen Eyre博士表示，过去科学家们常常会通过附近基因的搜寻方法去寻找引发疾病的关键致病基因，而实际上这远比想象中复杂的多，基因间的空白区域不光会对机体产生疾病效应，而且最新研究显示，这种空白区域并不会必然影响附近基因的表达，而其可以开启远距离基因的表达和关闭。
一段2米长的DNA可以通过折叠的方式包含于细胞内部，而这种折叠无意中就会使得空白区域接近非常重要的区域，从而控制基因表达的水平，在折叠DNA的特殊部位，增加不同疾病发病风险的区域或许会在同一个基因中碰见，而本文研究也发现某些基因或许可以增加个体患多种疾病的风险，而这取决于这些基因被空白区域调节方式的不同，当然这对于后期理解疾病的发病机制及开发新型潜在的疗法或将带来帮助。
下一步研究人员计划在不同类型细胞中鉴别出更多的相互作用。来帮助绘制新型图谱，来解释基因和空白区域之间如何通过相互作用来增加个体的患病风险；最后研究者Eyre说道，本文研究揭示了细胞内部相互作用远比我们想象中要复杂，而深入理解相互作用的发生机制对于开发新型疗法来治疗多种疾病或将提供一定思路。（基因宝jiyinbao.com）
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Capture Hi-C reveals novel candidate genes and complex long-range interactions with related autoimmune risk loci
Paul Martin, Amanda McGovern, Gisela Orozco, Kate Duffus, Annie Yarwood, Stefan Schoenfelder, Nicholas J. Cooper, Anne Barton, Chris Wallace, Peter Fraser, Jane Worthington & Steve Eyre
Genome-wide association studies have been tremendously successful in identifying genetic variants associated with complex diseases. The majority of association signals are intergenic and evidence is accumulating that a high proportion of signals lie in enhancer regions. We use Capture Hi-C to investigate, for the first time, the interactions between associated variants for four autoimmune diseases and their functional targets in B- and T-cell lines. Here we report numerous looping interactions and provide evidence that only a minority of interactions are common to both B- and T-cell lines, suggesting interactions may be highly cell-type specific; some disease-associated SNPs do not interact with the nearest gene but with more compelling candidate genes (for example, FOXO1, AZI2) often situated several megabases away; and finally, regions associated with different autoimmune diseases interact with each other and the same promoter suggesting common autoimmune gene targets (for example, PTPRC, DEXI and ZFP36L1).