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2016年3月9日 讯 /生物谷BIOON/ –名为基底细胞癌（BCC）的皮肤癌是最常见的一种癌症，90%的个体都有可能会在某一天发生，尤其是因为年龄原因及暴露于紫外线下；这种癌症很少致命，截至目前为止科学家们也对其研究较少；近日刊登在Nature Genetics的一项报告中，来自日内瓦大学的研究者就对基底细胞癌患者机体的癌细胞进行了DNA的测序研究，目的在于确定引发癌变的基因，该研究发现或为后期开发新型个体化疗法提供思路。
癌症取决于细胞中的DNA修饰，因为DNA修饰会引发细胞无线增殖，过去一段时间里科学家们就频繁利用DNA测序技术揭示引发癌症的遗传突变；如今科学家们开始关注基底细胞癌，研究者开展这项研究的目的就是对BCC肿瘤基因组进行测序，并且将其同健康个体的细胞进行比较，最终确定引发细胞癌变的原因。
文章中研究者对各年龄段的236名个体中的293份肿瘤样本进行研究，研究者Stylianos Antonarakis教授说道，长期以来大家都知道大部分的BCCs是由音猬因子（sonic hedgehog）通路的异常激活而引发的，但我们并不知道BCC同样也是一种具有高突变率的癌症；除了音猬因子通路外，许多其它的基因都参与到了引发皮肤癌的队列之中，最终就会使得疗法变得复杂。目前研究者鉴别出了MYCN， PTPN14和LATS1基因可以作为驱动BCC的原因。
研究者指出，他们开发了一种复杂的统计学分析软件，该软件可以帮助其在癌症DNA序列的成千上万个体细胞突变中对癌症基因进行定位，一旦发现癌症基因研究者就会对其是否作为癌症驱动子进行鉴定，比如通过观察携带和不携带突变的分子，以及对比其结构和功能就可以确定该基因是否为致癌基因。
每一个肿瘤都会因其拥有的特殊遗传突变而有着特殊之处，研究者建议对健康个体及癌症患者机体的肿瘤DNA进行测序来确定哪些基因主要引发癌症。研究者Nikolaev说道，精确的诊断技术可以帮助改善患者的治疗，细胞对不同的治疗方法反应不同，这或许取决于基因的突变情况，有些癌细胞对特殊药物产生了耐受性从而阻断疗法的进行，而我们检测到的基因突变或将帮助选择抵御耐药性肿瘤细胞的最佳疗法。
最后研究者说道，对肿瘤进行测序将会逐渐帮助我们进行临床的药物实践，而这对于每一个癌症患者而言都将是非常重要的。（基因宝jiyinbao.com）
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Genomic analysis identifies new drivers and progression pathways in skin basal cell carcinoma
Ximena Bonilla Laurent Parmentier Bryan King Fedor Bezrukov Gürkan Kaya Vincent Zoete Vladimir B Seplyarskiy Hayley J Sharpe Thomas McKee Audrey Letourneau Pascale G Ribaux Konstantin Popadin Nicole Basset-Seguin Rouaa Ben Chaabene Federico A Santoni Maria A Andrianova Michel Guipponi Marco Garieri Carole Verdan Kerstin Grosdemange Olga Sumara Martin Eilers Iannis Aifantis Olivier Michielin Frederic J de Sauvage Stylianos E Antonarakis Sergey I Nikolaev
Basal cell carcinoma (BCC) of the skin is the most common malignant neoplasm in humans. BCC is primarily driven by the Sonic Hedgehog (Hh) pathway. However, its phenotypic variation remains unexplained. Our genetic profiling of 293 BCCs found the highest mutation rate in cancer (65 mutations/Mb). Eighty-five percent of the BCCs harbored mutations in Hh pathway genes (PTCH1, 73% or SMO, 20% (P = 6.6 × 10−8) and SUFU, 8%) and in TP53 (61%). However, 85% of the BCCs also harbored additional driver mutations in other cancer-related genes. We observed recurrent mutations in MYCN (30%), PPP6C (15%), STK19 (10%), LATS1 (8%), ERBB2 (4%), PIK3CA (2%), and NRAS, KRAS or HRAS (2%), and loss-of-function and deleterious missense mutations were present in PTPN14 (23%), RB1 (8%) and FBXW7 (5%). Consistent with the mutational profiles, N-Myc and Hippo-YAP pathway target genes were upregulated. Functional analysis of the mutations in MYCN, PTPN14 and LATS1 suggested their potential relevance in BCC tumorigenesis.