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2016年7月4日 讯 /生物谷BIOON/ –Kataegis突变机制是科学家们近年来发现的一种现象，其是在基因组热点区域发生的多个突变簇，研究者此前在一些癌症中发现过这种异常情况，但他们并不清楚kataegis在肿瘤发生及病人预后过程中的作用；近日来自加利福尼亚州立大学圣地亚哥医学院和穆尔斯癌症中心(Moores Cancer Center)的科学家们通过研究发现，kataegis实际上是一种乳腺癌的阳性标记，携带这些突变热点的癌症患者往往侵袭性癌症较少，而且患者预后较好。
相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上，研究结果表明，患者机体的kataegis状态或可帮助医生们制定可以在患者机体中更好发挥作用的的新型疗法；研究者Kelly Frazer博士指出，我们并不知道引发kataegis现象的原因是什么，在这项研究之前我们也并不清楚kataegis机制在临床研究中的重要性。如今通过研究我们发现，kataegis机制和乳腺癌患者良好预后直接相关。
kataegis机制大约在55%的乳腺癌患者中发生，为了确定其在患者预后过程中所扮演的重要角色，研究者Frazer及同事对来自癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）计划中可用的人类乳腺癌数据库进行研究，最终研究者确定了97种乳腺肿瘤的kataegis状态，随后将相关信息同患者的数据进行匹配，比如患者诊断的年龄、疗法以及预后等，同时研究者还对另外412份被预测为kataegis状态的人类乳腺癌样本进行了分析。
研究者发现，多种临床因素和kataegis直接相关，同时这些突变热点往往在较晚年龄诊断出的乳腺癌患者中比较常见，同时在HER2阳性及高级别肿瘤患者中也比较常见；研究者Matteo D’Antonio认为，kataegis突变可以抑制附近基因的异常表达，附近基因的异常表达常常会引发肿瘤产生以及肿瘤侵袭。
除了可以提供较好的预后之外，kataegis状态或许还可以帮助确定患者的疗法选择，研究者证实了，携带kataegis的肿瘤往往含有较高水平的人类表皮生长因子受体II（HER2），HER2阳性的乳腺癌患者通常利用HER2靶向疗法进行治疗，这也就意味着这种类型肿瘤患者的预后往往相对较好。
最后研究者指出，未来还需要进行大量研究才能使得kataegis状态早日应用于临床治疗中，然而利用相关的基因组学数据，研究者已经可以帮助针对不同患者制定新型的个体化疗法了，比如目前正在进行临床试验的免疫疗法等。（基因宝jiyinbao.com）
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doi:10.1016/j.celrep.2016.06.026
PMC:
PMID:
Kataegis Expression Signature in Breast Cancer Is Associated with Late Onset, Better Prognosis, and Higher HER2 Levels
Matteo D’Antonio, Pablo Tamayo, Jill P. Mesirov, Kelly A. Frazer
Kataegis is a mutational process observed in ∼55% of breast tumors that results in hypermutation in localized genomic regions. Using whole-genome sequence data of 97 tumors, we examined the distribution of kataegis loci, showing that these somatic mutations are over-represented on chromosomes 8, 17, and 22 and enriched in genic regions and active chromatin elements. We show that tumors harboring kataegis are associated with transcriptome-wide expression changes consistent with low invasive potential. We exploit the kataegis expression signature to predict kataegis status in 412 breast cancers with transcriptome but not whole-genome sequence data and show that kataegis loci are enriched in high-grade, HER2+ tumors in patients diagnosed with breast cancer at an older age and who have a later age at death. Our study demonstrates that kataegis loci are associated with important clinical features in breast cancer and may serve as a marker of good prognosis.
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