英国建立世界最大微生物基因组云计算平台

2016年8月3日讯 /生物谷BIOON/ –最近英国华威大学等研究机构的研究人员基于云技术开发了一个目前全世界最大的微生物生物信息学平台。

这个叫做CLIMB的项目（Cloud Infrastructure for Microbial Bioinformatics）是属于英国医学微生物学团体和相关国际合作机构的生物信息学资源。该平台将通过提供免费的云计算，存储和分析工具支持科学研究。

华威大学的Mark Pallen教授负责领导该项目，他这样说道：“CLIMB为学术领域和临床领域的微生物学家和科研人员提供了软件和数据分享的一站式服务。使用云技术就意味着全国的研究团队不再需要自行建立和维护自己的服务器，使用者可以根据需要获取别人分享的计算资源。”

随着测序技术的发展提高，产生基因组数据已经变得越来越简单。但是许多学术机构仍然无法获取他们需要的资源来进行生物信息学分析。CLIMB平台将为他们分享资源帮助他们完成计算分析。该研究的领导者也有计划举办专题讨论小组和会议来进行培训，分享知识，进一步发展微生物生物信息学团体。

来自伯明翰大学的Nick Loman也参与了CLIMB研究，他这样说道：“我们已经使用CLIMB分析和分享了西非埃博拉病毒爆发的数据。这代表了科学协作的一个巨大变化，特别是在面对公共健康紧急事件的时候。”

Pallen教授补充道：“我们看到CLIMB已经不仅仅是一个学术平台，我们更希望它变成连接学术领域和公共健康领域专家们的一座桥梁，使这两个领域的团体之间除了可以交换软件和数据，还会在技巧，知识和方法的分享方面变得更加便捷。”（基因宝jiyinbao.com）

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doi: http://dx.doi.org/10.1101/064451 

CLIMB (the Cloud Infrastructure for Microbial Bioinformatics): an online resource for the medical microbiology community

Thomas Richard Connor, Nicholas James Loman, Simon Thompson, Andy Smith, Joel Southgate, Radoslaw Poplawski, Matthew J Bull, Emily Richardson, Matthew Ismail, Simon Elwood-Thompson, Christine Kitchen, Martyn Guest, Marius Bakke, Sam K Sheppard, Mark J Pallen

The increasing availability and decreasing cost of high-throughput sequencing has transformed academic medical microbiology, delivering an explosion in available genomes while also driving advances in bioinformatics. However, many microbiologists are unable to exploit the resulting large genomics datasets because they do not have access to relevant computational resources and to an appropriate bioinformatics infrastructure. Here, we present the Cloud Infrastructure for Microbial Bioinformatics (CLIMB) facility, a shared computing infrastructure that has been designed from the ground up to provide an environment where microbiologists can share and reuse methods and data.