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2016年9月7日讯 /生物谷BIOON/ –最近一项研究发现在ER阳性乳腺肿瘤中基因外部的DNA序列不断积累突变可能是驱动这种疾病发展的重要推手。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature Genetics上。
来自加拿大多伦多大学的研究人员领导了这项研究，高级科学家Mathieu Lupien表示：“通过研究在基因外部发现的DNA突变，我们发现基因外部的功能调控元件能够发生突变影响基因表达进而促进乳腺癌发育。”
多个研究机构组成的研究团队共同合作分析了在病人肿瘤中不断积累的DNA序列变化，这些变化与ER阳性乳腺癌细胞的表观遗传学特征有关。
“如果将基因比作基因组的光明之源，那么这项研究表明推动疾病发展的突变不仅会发生在灯泡上，还会直接改变灯的开关和调节器，也就是基因外部的功能性调控元件。”Dr. Lupien这样说道。
“我们不仅在基因内部，也在其他功能调控元件中寻找驱动疾病进展的突变，这样有助于扩展我们发现最佳生物标记物的能力，详细描述每个肿瘤的生物学基础，未来或可帮助病人找到更加准确的癌症治疗用药。”
Dr. Lupien的研究以2012年发表在国际学术期刊Nature Genetics上的一项研究为基础，之前研究揭示了44个已知的基因变异为何会增加乳腺癌风险。
不断加深对遗传变异和突变的了解可以促进科学向更加精确的临床检测的转化，进而为病人提供更加精确的疾病诊断。（基因宝jiyinbao.com）
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Noncoding somatic and inherited single-nucleotide variants converge to promote ESR1 expression in breast cancer
Swneke D Bailey, Kinjal Desai, Ken J Kron, Parisa Mazrooei, Nicholas A Sinnott-Armstrong, Aislinn E Treloar, Mark Dowar, Kelsie L Thu, David W Cescon, Jennifer Silvester, S Y Cindy Yang, Xue Wu, Rossanna C Pezo, Benjamin Haibe-Kains, Tak W Mak, Philippe L Bedard, Trevor J Pugh, Richard C Sallari & Mathieu Lupien
Sustained expression of the estrogen receptor-α (ESR1) drives two-thirds of breast cancer and defines the ESR1-positive subtype. ESR1 engages enhancers upon estrogen stimulation to establish an oncogenic expression program1. Somatic copy number alterations involving the ESR1 gene occur in approximately 1% of ESR1-positive breast cancers2, 3, 4, 5, suggesting that other mechanisms underlie the persistent expression of ESR1. We report significant enrichment of somatic mutations within the set of regulatory elements (SRE) regulating ESR1 in 7% of ESR1-positive breast cancers. These mutations regulate ESR1 expression by modulating transcription factor binding to the DNA. The SRE includes a recurrently mutated enhancer whose activity is also affected by rs9383590, a functional inherited single-nucleotide variant (SNV) that accounts for several breast cancer risk–associated loci. Our work highlights the importance of considering the combinatorial activity of regulatory elements as a single unit to delineate the impact of noncoding genetic alterations on single genes in cancer.