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推出超级测序仪Revolocity、BGISEQ-500之后，2016年11月5日，在第十一届国际基因组学大会（ICG-11）上，华大基因发布了其自主研发的高通量台式测序系统BGISEQ-50。
据悉，BGISEQ—50将会成为在全世界范围内同类型基因测序仪价格上最具竞争力的一款。该系统将于今年12月25日开始接受预定，并计划于2017年2月14日实现交付。
华大基因执行副总裁、华大智造执行总裁牟峰表示：“BGISEQ-50的诞生，标志着我国已完全具备了自主可控的核心测序技术和能力，将加速推动以基因科技为支撑的生命数字化建设。与此同时，华大基因将提供开放性平台，期待多方合作，共同开发基于基因科技的更多应用平台。”
第三款国产测序仪
资料显示，BGISEQ-50系统沿用了先进的联合探针锚定聚合技术（cPAS）和DNA纳米球（DNB）核心测序技术，采用高精密部件，内置独立的样本加载试剂槽和全自动试剂针穿刺系统，在简约化的结构中自动集成样品加载、测序和分析等多项功能。
据华大基因项目负责人之一刘健介绍，BGISEQ-50采用智能化图标触控式操作系统，兼容全自动样本追踪管理，提供最为优化的流程指引，测序操作极其简单。
“分别将预制的一体化测序试剂盒和高精度微加工的卡片式测序芯片装入机体，点击‘测序’按钮，10小时即可自动完成样本加载和测序，支持无人值守模式，应用分析一步到位。配备可选的自动化样本制备系统，18小时即可完成包括样本制备在内的全流程。”刘健说道。
去年6月，华大基因推出首款自主知识产权的超级测序仪Revolocity，该测序仪提供总体解决方案，包括最后的信息分析、数据挖掘。其主要定位是面向大型国家级研究中心，价格为1200万美元。
随后，去年10月24日举办的第十届国际基因组学大会（ICG-10）上，华大基因再次发布其自主研发的新型桌面化测序系统BGISEQ-500正式上线。
不同于Revolocity ，BGISEQ-500小巧便捷，适合一般的实验室和产业化公司，其定价也比同类测序仪的价格低三分之一。
并购攻克上游研发
在基因组学应用的产业链上，上游为测序仪器、设备和试剂供应商；中游为基因测序与检测服务提供商；下游为使用者，包括医疗机构、科研机构、制药公司和受检者。
其中，国内基因公司在中下游领域竞争优势明显。位于中下游第一方阵的企业包括四家：华大基因、贝瑞和康、达安基因、博奥生物。
但上游长期被外资厂商垄断。根据Genomeweb对全球测序仪器市场调查结果显示，数家美国公司占据了绝大部分市场份额，其中Illumina占据了全球测序仪器市场71%的份额，
华大基因研究院院长徐讯此前向记者坦言：“其实华大往上游走的一个很重要原因，是我们确实遇到了技术壁垒，比如最新的技术上游厂商不给你。这个限制现在依旧存在，可能还比以前更严重。”
为了冲破上游垄断，华大基因选定了通过收购实现测序仪器国产化的路径，并在2013年完成对CG的全额收购。彼时，CG只是一家一百多人的小公司，还面对约5000万美元的负债。
收购的效果立竿见影。
华大基因透露，自2015年底开始接受预订以来，其订购量已突破500台，完成超过112，000例实际样本测试。2016年10月，BGISEQ-500获得国家食品药品监督管理总局医疗器械注册证。
值得注意的是，除了华大基因通过收购布局上游，市场上还存在两种破除外资垄断上游设备市场的方式：第一种是本土企业联合外资基因检测设备生产商，采用贴牌的合作模式；第二种是完全自主研发、生产。
贴牌模式的典型代表是达安基因联合Life Technologies合资成立广州立菲达安诊断产品技术有限公司、贝瑞和康联合Illumina。
自主研发的代表是中科紫鑫。去年8月，中科紫鑫正式推出国内首款自主知识产权的测序仪——BIGIS，成功解决了“读长较短”的技术难题。目前，该测序仪已处于筹划批量生产阶段。（生物谷Bioon.com）