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Nat Commun:表观基因组改变或促进黑色素瘤变得更加“凶残”

Nat Commun:表观基因组改变或促进黑色素瘤变得更加“凶残”

2015年4月13日 讯 /生物谷BIOON/ –近日,刊登在国际杂志Nature Communications上的一篇研究论文中,来自鲁汶大学的研究人员通过研究揭示了黑色素瘤变得恶性的分子机理,相关研究或为后期阐明黑色素瘤发生的原理以及开发新型疗法提供一定的帮助和思路。

人类机体的DNA包含着许多信息,其可以使得我们的细胞有序工作,而来自DNA的信息流往往是通过“停泊”在DNA多种位置上的蛋白质来发挥作用的,整个过程都受到了紧密的调控,而且该过程对于外界因子的改变非常敏感。比如基因调节子或表观遗传改变都会改变DNA和细胞间的遗传信息流。

这项研究中,研究者表明,黑色素瘤由多种类型的细胞组成,肿瘤中的每一种亚细胞群都具有不同的特性,而到底是什么让黑色素瘤如此“凶恶”?研究者将箭头指向了引发癌症进展和转移的亚细胞群,这些细胞可以增加肿瘤对当前药物的耐受性。研究者还发现,这些亚细胞群并不是来自DNA自身的突变或错误,而是从DNA到细胞的信息流发生改变所致。在癌症发生第一阶段,特殊蛋白会结合在DNA的特殊位点,从而促进肿瘤生长;而第二阶段,即恶性进展阶段,结合在DNA其它位点上的蛋白质会被激活,从而促进癌细胞入侵并且扩散到机体其它组织中。

研究者Aerts表示,我们在黑色素瘤进展的各个阶段成功绘制了其表观遗传的蓝图,而且鉴别出了许多蛋白质及其结合的DNA区域;后期当我们对敲除这些蛋白后,黑色素瘤就会变得低侵袭性,而且对当前的癌症药物变得敏感。本文研究对于揭示黑色素瘤为何会变得恶性提供了一定的基础,同时也会开发治疗手段提供了新的希望。(基因宝jiyinbao.com)

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Decoding the regulatory landscape of melanoma reveals TEADS as regulators of the invasive cell state

Annelien Verfaillie, Hana Imrichova, Zeynep Kalender Atak, Michael Dewaele, Florian Rambow, Gert Hulselmans, Valerie Christiaens, Dmitry Svetlichnyy, Flavie Luciani, Laura Van den Mooter, Sofie Claerhout, Mark Fiers, Fabrice Journe, Ghanem-Elias Ghanem, Carl Herrmann, Georg Halder, Jean-Christophe Marine & Stein Aerts

Transcriptional reprogramming of proliferative melanoma cells into a phenotypically distinct invasive cell subpopulation is a critical event at the origin of metastatic spreading. Here we generate transcriptome, open chromatin and histone modification maps of melanoma cultures; and integrate this data with existing transcriptome and DNA methylation profiles from tumour biopsies to gain insight into the mechanisms underlying this key reprogramming event. This shows thousands of genomic regulatory regions underlying the proliferative and invasive states, identifying SOX10/MITF and AP-1/TEAD as regulators, respectively. Knockdown of TEADs shows a previously unrecognized role in the invasive gene network and establishes a causative link between these transcription factors, cell invasion and sensitivity to MAPK inhibitors. Using regulatory landscapes and in silico analysis, we show that transcriptional reprogramming underlies the distinct cellular states present in melanoma. Furthermore, it reveals an essential role for the TEADs, linking it to clinically relevant mechanisms such as invasion and resistance.

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