2017年3月24日/生物谷BIOON/—针对成年急性髓细胞白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者的一项新的大型研究将80种癌症相关基因突变与5种AML亚型相关联,这5种AML亚型可通过特异性的染色体异常加以确定。在未来,这些发现可能有助指导基因突变测试和治疗决策。
在来自美国俄亥俄州立大学综合癌症中心阿瑟-詹姆斯癌症医院和理查德-斯洛夫研究所的研究人员的领导下,这项研究包括1603名新确诊的成年AML患者,这些患者在美国多个中心开展的癌症与白血病B组/肿瘤学临床试验联盟(Cancer and Leukemia Group B/Alliance for Clinical Trials in Oncology)临床试验中接受治疗。
这些研究人员将确定着34种AML亚群的细胞遗传学异常与80种癌症相关基因的突变状态相结合在一起,产生一种“肿瘤印记(oncoprint)”,即针对与每种AML亚群相关的基因突变进行简明的表格总结。
正如在Leukemia期刊上报道的那样,这项研究鉴定出:
(1)这34种AML亚群之间的潜在重要的遗传差异;
(2)这些AML亚群与特异性的基因突变和功能基因组之间存在的意想不到的关联;
(3)小于60岁、60岁及以上的AML患者在细胞遗传学特征和突变特征方面存在的显著差异。
论文共同第一作者、俄亥俄州立大学/医师-科学家培训计划成员Ann-Kathrin Eisfeld博士说,“我们的研究在一张图片中总结了1603名AML成年患者的细胞遗传学信息和突变信息。鉴定出每种AML亚群的关键突变特征可能有助我们更好地理解不同的AML亚型的发病机理,并且为正在进行的和未来的研究提供大量信息。”
论文共同通信作者、俄亥俄州立大学知名教授Clara D. Bloomfield博士补充道,“如果我们的发现得到证实,那么这可能意味着我们的突变肿瘤印记可能有助指导突变测试和潜在地在未来为AML患者作出治疗决策。”
就这项研究而言,Eisfeld、Bloomfield和他们的同事们获得来自每名AML成年患者的预处理骨髓或外周血样品。在这些患者当中,1080人在60岁以下,523人在60岁或以上。所有的这些患者在癌症与白血病B组(Cancer and Leukemia Group B)临床试验中接受相类似的治疗。
根据每名患者的白血病细胞是否存在特异性的染色体异常,他或她经确诊后可归为5种AML亚型中的一种和34种AML亚群中的一种。没有染色体异常的AML患者被分类为患有细胞遗传学正常的AML(cytogenetically normal AML, CN-AML)。
这些患者的白血病细胞接受测序以便了解80种癌症/白血病相关基因的突变状态。基于这些基因的生物学功能,这些突变被分配给9种类型(比如,甲基化相关的,黏连蛋白复合体,染色质重塑,肿瘤抑制基因)。
这些研究人员在这些患者中鉴定出4390种基因突变,平均每名患者发生3种突变。总体而言,在这些患者当中,导致AML产生的最常见突变基因属于甲基化类型。
这种突变肿瘤印记的关键遗传差异包括:
(1)CN-AML患者、复杂核型AML患者或非平衡染色体异常的AML患者的甲基化相关基因存在较高的突变发生率;
(2)相比之下,甲基化相关基因的突变在CBF-AML患者体内几乎是缺乏的,或者在非CBF-AML相关平衡易位或倒置的患者体内是更加罕见的;
(3)剪接体基因突变在非平衡染色体异常的患者体内是比较常见的,特别是在那些染色体4三体综合征患者、染色体8三体综合征患者、染色体11三体综合征患者、染色体13三体综合征患者或染色体21三体综合征患者患者。(生物谷 Bioon.com)
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原始出处:
A-K Eisfeld, K Mrózek, J Kohlschmidt et al. The mutational oncoprint of recurrent cytogenetic abnormalities in adult patients with de novo acute myeloid leukemia. Leukemia, Accepted article preview online 21 March 2017, doi:10.1038/leu.2017.86