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Nature genetics:家系基因研究揭示自闭症风险新线索

                                                                

Nature genetics:家系基因研究揭示自闭症风险新线索

2015年5月14日讯 /生物谷BIOON/ –近日,一项研究对2377名自闭症儿童及其父母和未患病的兄弟姐妹进行了遗传分析,为自闭症的遗传学研究提供了重要启示。这项研究发表在国际学术期刊nature genetics。
 
过去几年里,科学家们在发现自闭症风险基因方面取得了显著进步,特别是发现了一些新出现的基因突变,对于自闭症发生具有重要促进作用,这些新突变只在患病儿童中出现,而不存在于其父母身上,但这些新发现突变又不能解释所有的自闭症发生。
 
在这项研究中,研究人员为衡量遗传突变与新发突变对自闭症风险的相对影响,利用2377个自闭症家庭的外显子单核苷酸变异和拷贝数变异分析结果构建了一个合集。通过对这个合集中的数据进行分析,研究人员发现母亲遗传给儿子的突变会造成最强的自闭症风险效应,这表明女性携带相关突变可能不会发展为自闭症,而这些突变遗传给男性后代便会导致自闭症患病高风险的出现。
 
同时,这项研究还提供了一个比较全面的自闭症风险基因图谱,利用这一图谱科学家们能够对比较小的单碱基对突变进行分析,也能够对基因组中的大片段突变进行分析,大大方便了对自闭症遗传基础的分析研究。
 
最后,研究人员指出了解这些基因突变影响的生物学过程以及这些突变基因编码的蛋白,对于寻找诊断和治疗自闭症的有效方法具有很大帮助,因此该研究具有非常重大的指导意义。(基因宝jiyinbao.com)
 
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Nature genetics:家系基因研究揭示自闭症风险新线索
 
 
Excess of rare, inherited truncating mutations in autism
 
Niklas Krumm,Tychele N Turner,Carl Baker,Laura Vives,Kiana Mohajeri,Kali Witherspoon,Archana Raja,Bradley P Coe,Holly A Stessman,Zong-Xiao He,Suzanne M Leal,Raphael Bernier & Evan E Eichler
 
To assess the relative impact of inherited and de novo variants on autism risk, we generated a comprehensive set of exonic single-nucleotide variants (SNVs) and copy number variants (CNVs) from 2,377 families with autism. We find that private, inherited truncating SNVs in conserved genes are enriched in probands (odds ratio = 1.14, P = 0.0002) in comparison to unaffected siblings, an effect involving significant maternal transmission bias to sons. We also observe a bias for inherited CNVs, specifically for small (<100 kb), maternally inherited events (P = 0.01) that are enriched in CHD8 target genes (P = 7.4 × 10?3). Using a logistic regression model, we show that private truncating SNVs and rare, inherited CNVs are statistically independent risk factors for autism, with odds ratios of 1.11 (P = 0.0002) and 1.23 (P = 0.01), respectively. This analysis identifies a second class of candidate genes (for example, RIMS1, CUL7 and LZTR1) where transmitted mutations may create a sensitized background but are unlikely to be completely penetrant.
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