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上海2018年4月2日讯 /生物谷BIOON/ –3月30日，由生物谷主办的2018(第四届)肠道微生态与健康国际研讨会隆重召开。深圳华大生命科学研究院宏基因组研究所所长，深圳市海外高层次人才“孔雀计划”B类人才，美国凯斯西储大学生物化学博士，霍华德•修斯医学研究所及北卡罗来纳大学教堂山分校莱恩伯格综合癌症中心博士后、美国白血病与淋巴瘤学会博士后奖学金（LLS Fellow）获得者贾慧珏所长为我们介绍了宏基因组大数据时代以及他们团队卓越的研究。
贾慧珏2012年成为英国《自然》出版集团第一位来自中国本土的科学编辑（Nature Communications）。2013年加入华大基因研究院宏基因组方向以来，在人体肠道、口腔、生殖道等部位共生菌群与疾病关系方面同国内外学者开展了多项国际领先的研究，在Nature Biotechnology、Nature Medicine、Nature Reviews Microbiology等杂志发表论文。
自2012年贾慧珏所长发表于Nature的糖尿病研究开始，华大宏基因组团队比照GWAS方法首创的宏基因组关联分析（MWAS）方法已经被用于多种代谢性、免疫性疾病，并且从肠道拓展至口腔、生殖道等其他部位。
宏基因组鸟枪法测序是微生物学领域继显微镜发明之后的又一重大突破，能够获得环境样品中所有已知和未知物种的基因信息、完整反映微生物群落。华大2008年作为唯一的非欧盟单位参与欧盟第七框架支持的MetaHIT计划，2010年在Nature杂志发表封面文章，在国际上首创了用高通量测序数据进行短序列组装、构建人体肠道菌群参考基因集、获得宏基因组样品中所有已知和未知物种基因的信息分析方法。此方法在后续研究中被用于疾病解析、新种发现、宏转录组和宏蛋白组分析。2014、2016年采用最新流程对中、美、欧三地共千余例粪便样品系统地进行组装与分析，获得的高质量参考集包含约1000万个基因，完整代表了肠道菌群这一人体“另一套基因组”（Nature Biotechnology、Cell Systems）。
同时，贾慧珏所长还介绍了至少数十种药物影响肠道菌群，都能够对临床收样带来一定的挑战，例如服用二甲双胍的2型糖尿病病人较未服用的病人大肠杆菌高、Intestinibacter低。2017年基于中国人粪便样品的Nature Communications合作研究显示，美国克利夫兰诊所Stanley Hazen教授团队深入研究十余年的氧化三甲胺相关基因确实在动脉粥样硬化性心血管疾病样品中富集，但并不是唯一失调的基因。与糖尿病、肥胖、肝硬化这些已有百余例中国人宏基因组数据的代谢性疾病一起，既有共性、又有特异性的菌群标志物的这些趋势有望在样品增多以后进一步明晰。
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