2015年7月10日讯 /生物谷BIOON/ –本文亮点:
●本文描述了对hPSC细胞系进行可诱导基因敲除的有效方法
●Dual-sgRNA的靶向作用对于FRT进行双等位基因精确敲入至关重要
●可诱导的基因敲除在分化任意阶段的所有细胞中都可实现
●利用这种方法还可以进行多基因的可诱导性敲除
近日,来自美国威斯康星大学的华人科学家Su-Chun Zhang在国际学术期刊Cell Stem Cell发表了一项最新研究进展,他们利用CRISPR/CAS9技术实现了对人类干细胞系进行可诱导基因敲除,这一方法的成功对于研究基因在干细胞及分化不同阶段中的作用具有重要推动作用。
对基因表达进行精确的时间调控对于阐明一个基因在生物学系统中的功能至关重要,但到目前为止,在人类多能干细胞中实现可诱导基因敲除,建立可诱导基因敲除的人类干细胞系仍存在很大挑战。
在该项研究中,研究人员结合CRISPR/CAS9介导的基因组编辑和Flp/FRT以及Cre/LoxP系统成功实现建立了可诱导基因敲除的人类多能干细胞系。研究人员发现dual-sgRNA的靶向作用对于将FRT序列进行精确的双等位基因敲入非常重要。除此之外,他们还开发了出一种新的策略将一个可调控活性的重组酶表达体系同时导入细胞,移除了药物抗性基因,利用这种方法可以加快iKO hPSC细胞系的获得速度。
研究人员通过这种两步法敲除策略,对人类胚胎干细胞和诱导多能干细胞中的SOX2,PAX6,OTX2,AGO2等基因实现了可诱导性基因敲除,建立了相关细胞系。
研究人员相信,利用这种方法建立iKO hPSC细胞系将会改变人们以往对人类细胞中基因功能研究的方式,对于推动干细胞研究进展具有重要意义。(基因宝jiyinbao.com)
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DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.stem.2015.06.001
Engineering Human Stem Cell Lines with Inducible Gene Knockout using CRISPR/Cas9
Yuejun Chen6correspondenceemail, Jingyuan Cao6, Man Xiong6, Andrew J. Petersen, Yi Dong, Yunlong Tao, Cindy Tzu-Ling Huang, Zhongwei Du, Su-Chun Zhang
Precise temporal control of gene expression or deletion is critical for elucidating gene function in biological systems. However, the establishment of human pluripotent stem cell (hPSC) lines with inducible gene knockout (iKO) remains challenging. We explored building iKO hPSC lines by combining CRISPR/Cas9-mediated genome editing with the Flp/FRT and Cre/LoxP system. We found that “dual-sgRNA targeting” is essential for biallelic knockin of FRT sequences to flank the exon. We further developed a strategy to simultaneously insert an activity-controllable recombinase-expressing cassette and remove the drug-resistance gene, thus speeding up the generation of iKO hPSC lines. This two-step strategy was used to establish human embryonic stem cell (hESC) and induced pluripotent stem cell (iPSC) lines with iKO of SOX2, PAX6,OTX2, and AGO2, genes that exhibit diverse structural layout and temporal expression patterns. The availability of iKO hPSC lines will substantially transform the way we examine gene function in human cells.