CRISPR/Cas9基因编辑最新亮点论文一览

2015年1月24日讯 /生物谷BIOON/ –CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种后天免疫系统，其以消灭外来的质体或者噬菌体并在自身基因组中留下外来基因片段作为“记忆”。CRISPR/Cas系统全名为常间回文重复序列丛集/常间回文重复序列丛集关联蛋白系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated proteins)。目前已发现三种不同类型的 CRISPR/Cas系统，存在于大约40%和90%已测序的细菌和古菌中。其中第二型的组成较为简单，以Cas9蛋白>以及向导RNA(gRNA)为核心的组成。由于其对DNA干扰(DNAi)的特性，目前被积极地应用于遗传工程中，作为基因体剪辑工具，与锌指核酸酶(ZFN)及类转录活化因子核酸酶(TALEN)同样利用非同源性末端接合(NHEJ)的机制，于基因体中产生去氧核糖核酸的双股断裂以利剪辑。二型CRISPR/Cas并经由遗传工程的改造应用于哺乳类细胞及斑马鱼的基因体剪辑。其设计简单以及操作容易的特性为最大的优点，未来将可应用在各种不同的模式生物当中。

由于CRISPR/Cas技术作为一种最新涌现的基因组编辑工具，能够完成RNA导向的DNA识别及编辑，为构建更高效的基因定点修饰技术提供了全新的平台，受到众多科学家的追捧。CRISPR-Cas技术是继锌指核酸酶（ZFN）、ES 细胞打靶和 TALEN 等技术后可用于定点构建基因敲除大、小鼠动物的第四种方法，且有效率高、速度快、生殖系转移能力强及简单经济的特点，在动物模型构建的应用前景将非常广阔。

下面小编为大家盘点一下近期跟CRISPR/Cas9相关的最新研究论文。

【1】Small indels induced by CRISPR/Cas9 in the 5′ region of microRNA lead to its depletion and Drosha processing retardance.

在microRNA的5’端区域通过CRISPR/Cas9诱导的小片段插入缺失引起microRNA的消耗及酶类 RNase III（Drosha）加工的迟缓

RNA Biol. 2015 Jan 15

【2】Gene targeting via homologous recombination in monkey embryonic stem cells using CRISPR/Cas9 System.

在猴子胚胎干细胞中利用CRISPR/Cas9系统通过同源重组实现对基因的打靶

Stem Cells Dev. 2015 Jan 12

【3】Generation of Genomic Deletions in Mammalian Cell Lines via CRISPR/Cas9.

在哺乳动物细胞系中利用CRISPR/Cas9来进行一代基因突变

J Vis Exp. 2014 Jan 3;(83). doi: 10.3791/52118.

【4】Fanconi Anemia Gene Editing by the CRISPR/Cas9 System.

利用CRISPR/Cas9系统实现对范可尼贫血疾病患者机体的基因编辑

Hum Gene Ther. 2014 Dec 29

【5】Dual sgRNA-directed gene knockout using CRISPR/Cas9 technology in Caenorhabditis elegans.

利用CRISPR/Cas9 基因编辑技术对秀丽隐杆线虫进行双重sgRNA定向基因的敲除

Sci Rep. 2014 Dec 22;4:7581. doi: 10.1038/srep07581.

【6】Efficient ablation of genes in human hematopoietic stem and effector cells using CRISPR/Cas9.

利用CRISPR/Cas9在人类的造血干细胞和效应细胞中实现有效的基因剔除

Cell Stem Cell. 2014 Nov 6;15(5):643-52. doi: 10.1016/j.stem.2014.10.004

【7】Targeting Hepatitis B Virus With CRISPR/Cas9.

利用CRISPR/Cas9对乙肝病毒靶向作用

Mol Ther Nucleic Acids. 2014 Dec 16;3:e216. doi: 10.1038/mtna.2014.68

【8】CRISPR/Cas9-mediated genome editing of Epstein-Barr virus in human cells.

在人类细胞中实现CRISPR/Cas9介导的EB病毒的基因组编辑

J Gen Virol. 2014 Dec 12. pii: jgv.0.000012. doi: 10.1099/jgv.0.000012

【9】MAGeCK enables robust identification of essential genes from genome-scale CRISPR/Cas9 knockout screens.

在基因组尺度上利用CRISPR/Cas9 技术进行敲除筛选使得MAGeCK可以增强必要基因的鉴别

Genome Biol. 2014 Dec 5;15(12):554.

【10】Simple and rapid in vivo generation of chromosomal rearrangements using CRISPR/Cas9 technology.

利用CRISPR/Cas9技术可以快速简单实现体内染色体的重排

Cell Rep. 2014 Nov 20;9(4):1219-27. doi: 10.1016/j.celrep.2014.10.051

【11】A CRISPR/Cas9-Based System for Reprogramming Cell Lineage Specification.

基于CRISPR/Cas9来对细胞谱系进行重编程

Stem Cell Reports. 2014 Dec 9;3(6):940-7. doi: 10.1016/j.stemcr.2014.09.013

【12】Editing plant genomes with CRISPR/Cas9.

利用CRISPR/Cas9技术对植物基因组进行编辑

Curr Opin Biotechnol 2014 Nov 29;32C:76-84. doi: 10.1016/j.copbio.2014.11.007

【13】Enhanced specificity and efficiency of the CRISPR/Cas9 system with optimized sgRNA parameters in Drosophila.

在果蝇中利用优化的sgRNA参数来增强CRISPR/Cas9 系统的特异性和有效性

Cell Rep. 2014 Nov 6;9(3):1151-62. doi: 10.1016/j.celrep.2014.09.044

【14】TALEN and CRISPR/Cas9-mediated genome editing in the early-branching metazoan Nematostella vectensis.

在后生动物Nematostella vectensis的早期分支中利用TALEN和CRISPR/Cas9技术进行基因组编辑

Nat Commun. 2014 Nov 24;5:5486. doi: 10.1038/ncomms6486.

【15】Targeting non-coding RNAs with the CRISPR/Cas9 system in human cell lines.

在人类细胞系中利用CRISPR/Cas9 系统靶向作用非编码的RNAs

Nucleic Acids Res. 2014 Nov 20

【16】CRISPR/Cas9-mediated conversion of eGFP- into Gal4-transgenic lines in zebrafish.

在斑马鱼中利用CRISPR/Cas9介导eGFP向Gal4转基因株系进行转化

Nat Protoc. 2014 Dec;9(12):2823-40. doi: 10.1038/nprot.2014.187

【17】Megabase-scale deletion using CRISPR/Cas9 to generate a fully haploid human cell line.

利用CRISPR/Cas9 实现兆碱基级别的剔除来产生完整单倍体的人类细胞系

Genome Res. 2014 Dec;24(12):2059-65. doi: 10.1101/gr.177220.114

【18】In vivo engineering of oncogenic chromosomal rearrangements with the CRISPR/Cas9 system.

利用CRISPR/Cas9 基因编辑系统在体内实现工程化的致瘤染色体的重组

Nature. 2014 Dec 18;516(7531):423-7. doi: 10.1038/nature13902.

【19】Genome modification by CRISPR/Cas9.

利用CRISPR/Cas9系统实现基因组的修饰

FEBS J. 2014 Dec;281(23):5186-93. doi: 10.1111/febs.13110

【20】Efficient gene targeting in golden Syrian hamsters by the CRISPR/Cas9 system.

利用 CRISPR/Cas9 系统在金黄地鼠机体中实现有效的基因靶向作用

PLoS One. 2014 Oct 9;9(10):e109755. doi: 10.1371/journal.pone.0109755

【21】Programmable RNA recognition and cleavage by CRISPR/Cas9.

利用CRISPR/Cas9进行可编程的RNA的识别及分裂

Nature. 2014 Dec 11;516(7530):263-6. doi: 10.1038/nature13769

【22】Efficient generation of knock-in transgenic zebrafish carrying reporter/driver genes by CRISPR/Cas9-mediated genome engineering.

利用CRISPR/Cas9介导的基因工程化技术在携带报道/驱动基因的转基因斑马鱼机体中实现基因的有效敲除

Sci Rep. 2014 Oct 8;4:6545. doi: 10.1038/srep06545

【23】An efficient genotyping method for genome-modified animals and human cells generated with CRISPR/Cas9 system.

利用CRISPR/Cas9 系统开发出了一种新型的用于进行动物和人类细胞基因组修饰的有效分型方法

Sci Rep. 2014 Sep 19;4:6420. doi: 10.1038/srep06420

【24】Prevention of muscular dystrophy in mice by CRISPR/Cas9-mediated editing of germline DNA.

通过CRISPR/Cas9介导的种系DNA编辑可有效抑制小鼠肌肉萎缩症的发生

Science. 2014 Sep 5;345(6201):1184-8. doi: 10.1126/science.1254445.

【25】Whole-genome sequencing analysis reveals high specificity of CRISPR/Cas9 and TALEN-based genome editing in human iPSCs.

全基因组测序技术揭示了CRISPR/Cas9 和TALEN可以在人类iPSCs中实现高效的基因编辑

Cell Stem Cell. 2014 Jul 3;15(1):12-3. doi: 10.1016/j.stem.2014.06.011.

【26】Genome-wide identification of CRISPR/Cas9 off-targets in human genome.

利用CRISPR/Cas9 对人类基因组中的脱靶点进行全基因组鉴别

Cell Res. 2014 Aug;24(8):1009-12. doi: 10.1038/cr.2014.87.

【27】Efficient gene disruption in diverse strains of Toxoplasma gondii using CRISPR/CAS9.

利用CRISPR/CAS9技术对多种弓形虫进行有效的基因破坏

MBio. 2014 May 13;5(3):e01114-14. doi: 10.1128/mBio.01114-14.

【28】High-throughput screening of a CRISPR/Cas9 library for functional genomics in human cells.

在人类细胞的功能性基因组中对CRISPR/Cas9 文库进行高通量筛选

Nature. 2014 May 22;509(7501):487-91. doi: 10.1038/nature13166

【29】CRISPR/Cas9 for genome editing: progress, implications and challenges.

CRISPR/Cas9 技术进行基因组编辑的进展、应用及未来面对的挑战

Hum Mol Genet. 2014 Sep 15;23(R1):R40-6. doi: 10.1093/hmg/ddu125

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