导语:近日,上海其明信息技术有限公司官方表示,旗下GCBI项目已完成500万人民币的天使轮融资,投资方为上海张江火炬创投。此次融资主要针对GCBI的业务规模扩大、服务标准化建设和产品研发等。GCBI作为国内首个基因云项目,其建设和完善将标志着我国基因云工程建设进入新的篇章。
1985年,美国科学家率先提出人类基因组计划,人类踏上了对自身奥秘探索的征程。2006年,1号染色体基因测序成功,解读人体基因密码的”生命之书”宣告完成。由此,以基因组测序为基础的新型医疗模式–精准医疗,逐渐进入了公众视野,美国总统奥巴马更是在今年年初的国情咨文演讲中启动精准医疗计划,一期投入2.15亿美元,精准医疗已然步入了黄金时代。然而,精准医疗行业的快速发展是建立在大量的基因数据和完整的数据库之上的,这样一来就需要一个平台将已有公开的基因数据集中储存,并通过独立可靠的大数据算法将庞大的数据分析成对研究人员有可用价值的数据分析结果。但是,通过传统线下手段,这些数据从收集到分析大多依赖工具而成,需要专家、需要算法、需要会写程序,导致基因分析速度非常缓慢,给科研和医疗人员造成极大的困扰。解决这一问题的最佳方法就是建立一个基因大数据云端信息中心,运用独立的算法进行个性化的分析,提高数据分析效率和精准度。目前在国外基因数据储存市场已经初具规模,而GCBI作为国内首个云基因平台也受到越来越多的关注,根据对研究人员和分析师的采访显示,学术机构和医疗单位对GCBI基因云给予高度地肯定,有望成为行业数据分析与共享的新平台。
据了解,GCBI是由上海其明信息技术有限公司(简称”其明公司”)开发的一个基于云计算的基因信息分析平台。近日,公司官方表示,GCBI项目已完成500万人民币的天使轮融资,投资方为来自于国家级生物医药科技产业基地–张江高新技术产业开发区旗下的张江火炬创投。其明公司在2014年的销售收入达到2000万人民币,此次融资希望通过与资本市场合作,快速推进基因云计算在中国精准医疗领域的产业布局。
一杯咖啡的时间决定吃什么药,这或许不是玩笑
此前曾有多家媒体关注并报道GCBI基因云,媒体称其为亿万级产业,并形象地将其功能描绘成”一杯咖啡的时间决定吃什么药”。那么,这一杯咖啡的时间GCBI到底做了什么呢?笔者有幸受邀进入平台了解基因大数据分析,客观陈述一些个人体验供大家参考。
GCBI什么样?笔者受邀登陆GCBI平台,非常简洁明了的搜索引擎界面,在界面最右侧,可以切换中文语言。GCBI拥有超过20TB的知识数据存量,这是其建立大数据分析的基础。GCBI主界面分为GCBI-Pubmed、GCBI-Dictionary、GCBI-Sample三个部分:Pubmed是一个免费提供医学文献的搜索引擎,可以帮助学者更高效地寻找资料;GCBI-Dictionary不仅仅是基因辞典那么简单,它是在讲述基因的故事,这个基因在人体里起到什么作用,跟哪些疾病有关,都会一一展示,值得一提的是,某个基因最新的研究进展也会不断在基因故事中更新;GCBI-Sample有120万份基因样本,里面主要记录着每一粒样本的电子版信息,且样本库以每年56%的速度增长,未来还将加入更多的中国人样本信息,这些信息还将携带者更有价值的临床信息和用药信息,让数据大而有价值。
GCBI怎么做分析?原本耗时数月且复杂的基因数据分析工作,通过GCBI在线基因大数据分析,只需要几分钟就能搞定。一般情况下,医学人员获得个人的细胞、血液等测序数据和芯片数据后,会外包给第三方企业进行数据分析。这些公司拿到数据后,又通过各种分散的软件进行分析。医生与企业之间要沟通分析的角度和方法,企业也需要有数据分析专家、软件和数据库,增加了时间成本与精力成本。但如果是在GCBI基础之上,这个问题仅用一个鼠标和键盘就可以解决,医生要做的只是把检测数据上传到GCBI上,半小时之后便可以得到分析结果,而且这些结果还附带许多相关的基因知识,也就是上面所提到的基因故事,整个操作流程简单快速,就算是一个完全不懂生物信息的医生也能驾轻就熟。
基因云储存市场潜力巨大,未来可期
今年中旬《路透社》有报道称,对于备受瞩目的基因云储存行业,亚马逊和谷歌均虎视眈眈,欲抢夺这一市场,分析人士指出,到2018年,该市场规模可达每年10亿美元。
其实基因云的发展主要原因还是目前个性化治疗的兴起,也就是精准医疗。以肺癌的治疗和药物研发为例,精准医疗的科研人员对肺癌的病理会从基因层面入手,检测某肺癌样本之后,通过数据分析,发现他的某个基因发生表达导致另一个基因出现某种情况的表达。这时科研用户再根据数据结果,用某种医学手段或者研发中的药物对这个基因进行干扰,之后再次检测样本上的基因,数据分析过后,观察该基因有没有发生变化,这样就可以知道这个医疗手段或药物是否可以治愈疾病。
从中我们不难看出,精准医疗的关键核心要素就是基因信息分析,这需要大量的数据来分析不同方案对于不同基因的疗效。传统手段的线下分析不仅耗时长,而且数据分散,无法集中,会产生基因信息资源的浪费,已经成为精准医疗发展的掣肘因素。通过基因云的建设,科研学者可以通过平台分享自己和使用他人的基因数据成果,最终形成大数据,创造出因人而异,难病可治的新机会。
笔者了解到,GCBI从数据库方面已经加入更多带有临床数据的高质量样本和药物数据库,未来将会构建一个中国最大的基因数据共享数据平台,这些数据将直接帮助临床医生,在指导药物治疗和靶向治疗方面起到非常大的作用。(基因宝jiyinbao.com)